El IUCES se organiza actualmente en la siguientes divisiones:
División de Neurociencia Computacional
División de Sistemas de Información Móviles
División de Percepción y Robótica
División de Estructura de Datos y Lingüística Computacional
División de Empresa, Tecnología, Comportamiento y Sostenibilidad
División Arquitectura y Concurrencia
División de Estrategia y Negocios Internacionales
División de Dirección de Marketing, RSC y Empresa Familiar
División Centro de Innovación para la Sociedad de la Información (CICEI)